מכונת את או בשמו הנפוץ פוליגרף נעשה שימוש נרחב ולמטרות שונות ובמגזרים שונים.
שימוש רב נעשה בבדיקות פוליגרף במערכת הביטחון האחת למטרת בדיקות מהימנות והשנייה למטרת קידום חקירות פליליות במישור הביטחוני. על אף שידוע כי בדיקת פוליגרף אינה משמשת כראייה בהליך הפלילי הרי השימוש בפוליגרף נועד להביא לקידום בחקירה.
הפוליגרף ישמש במקרים של הליכים פליליים להליכי מעצר בלבד . כל זאת לאור רצון המחוקק לשמור על חוק כבוד האדם וחירותו. שימוש נרחב נעשה בבדיקות פוליגרף על ידי חברות הביטוח וזאת כדי למנוע מצבי ם כי ישולמו תגמולי ביטוח למבוטחים שלא זכאים לתגמולים אלו מסיבות של אי דיווח אמת בתביעה לחברת הביטוח ולהשגת תגמולי ביטוח במרמה. לעומת אותם מבוטחים שמנסים לרמות את חברות הביטוח ישנן מבוטחים שזכאים לתגמולים אלו לאחר שדיווחו אמת ובעזרת בדיקת פוליגרף יזורז תשלום תגמולי הביטוח שהם זכאים להם.
שימוש בפוליגרף ביחסי עבודה אם בתהליך קבלת עובד חדש או במהלך עבודתו בבדיקות מהימנות או לאחר אירוע כלשהו שמצריך לבדוק עובד ספציפי או מספר עובדים .
בבתי משפט אזרחים הפוליגרף הוא כלי בעל משמעות רבה בתחומים רבים כאשר מתבצע בהסכמת הצדדים להתדיינות, ובדיקה זו תקבל תוקף של אחת מן הראיות במשפט ולא הראייה המכרעת. לנושא הקבילות בתחום האזרחי נקבעו הלכות רבות כגון הלכת "ביאזי" שהיא הלכה חשובה ובעלת משמעות רבה בישראל על פי ההסכם שנכרת בין הצדדים שהגיעו להסכמה על בדיקת פוליגרף והחליטו כי יקבלו על עצמם את מסקנות הבדיקה . בית המשפט המחוזי נתן תוקף להסכם בדבר קבלת ממצאי הפוליגרף כראייה מכרעת. על פי בית המשפט אם מסכימים הצדדים על קיומה של בדיקת פוליגרף ועל הכרעה על פיה הדבר מקובל ואף ראוי, ובית המשפט יקבל ויעבד הסכמה זו וייתן לה תוקף.