רבים הם השימושים במכונת אמת הלא היא הפוליגרף. בבדיקת פוליגרף נעזרים מעסיקים לצורך מיון וסינון עובדים,
בדיקת מהימנות תקופתית לאיתור עובדים המועלים בכספי העסק או בגנבות סחורה.
חברות ביטוח משתמשות בפוליגרף על מנת לוודא כי דרישת הפיצוי על ידי מבוטח הינה דרישה לגיטימית ואינה מוגזמת ביחס לאירוע בה המבוטח תובע את חברת הביטוח ,וכן לוודא אכן האירוע בגינו מבקש המבוטח פיצוי אכן אירע.-.
דרישת חברת הביטוח לביצוע בדיקת פוליגרף הינה הצעה למבוטח ואינה חובה.
המבוטח רשאי לסרב להצעת חב' הביטוח לביצוע הבדיקה וסירובו לא יהיה לו לרועץ.
לעיתים מבוטח מבקש להיבדק מיוזמתו על מנת להוכיח לחברת בביטוח כי תביעתו הינה מוצדקת וכספי הפיצוי שהוא דורש אכן מגיעים לו, בקשתו באה גם על מנת לזרז את הליכי התשלום על ידי חברת הביטוח.
בתי משפט , בתי דין ובוררים נוהגים להציע למתדיינים לבצע בדיקת פוליגרף בהסכמת הצדדים , הצעה זו תבוא כאשר גרסאות הצדדים הינן מנוגדות ולא ניתן לדעת מי מבין הצדדים דובר אמת ומי דובר שקר. בדיקת הפוליגרף תעזור לקבל החלטות על פי ממצאי הבדיקה.
שימושים נוספים לפוליגרף הם ביחסים בין אישיים כגון חשד לבגידות בני ה זוג מבקשים לאוששלהזים את גרסת מי מבין הזוג החשד בבגידה.
חשדות למעשים מגונים , גנבות מעילות מביאים את החשודים לבדיקה לברור מעורבות אלו להזים את החשד. אנשים מבקשים להיבדק בפוליגרף כאשר אין דרך אחרת או ראייה נוספת שתוכיח את כי ידם בחשד המיוחס להם .