תרומה חשובה להצלחת בדיקת פוליגרף היא הבנתו של בודק הפוליגרף והכרתו את הגורמים המשפיעים ומניעים את רגשותיו של האדם.
יכולתו של בודק פוליגרף נמדדת בבניית מבדק אשר יכלול שאלות בשיטה מדעית שמהן ניתן יהיה להפיק תגובות פיזיולוגיות אשר יאפשרו לאבחן אמת או שקר על ידי מכונת אמת . תחושות עמוקות הנובעות מאירועים דרמטיים מניבים ריגושים אשר נוצרו מחבירה בין המח לגוף . חבירה זו בין המח והגוף יוצרת בגוף שינויים פיזיולוגיים אשר נועדו לאפשר לגוף להתמודד מול הבעיה .
רמת השינויים הפיזיולוגיים בגוף האדם תלויה בעוצמת הריגושים והמצב אליו נקלע. כאשר עוצמת הרגישות קלה , השינויים הפיזיולוגיים הינם קלים בעת שהאדם נמצא בפחד מצוי חלים שינויים בקצב הדופק , עליה בלחץ הדם ובקצב הנשימה.
על מנת להתמודד מול הפחד והמצב אליו נקלע האדם, גופו מתאים עצמו לקראת מאבק בו הוא זקוק לאנרגיה נוספת.
כאשר ההתרגשות חזקה , השינויים הפיזיולוגיים מתעצמים , בהיותנו בתחושת פחד כבדה, גופנו נדרך למאבק הישרדות אשר משמעותו להלחם או להימלט. ניתן לדמות התרגשות זו כמו דבר חדש שבנאדם לא ראה לפני והוא רואה בפעם הראשונה וזה מרגש אותו מאוד. לדוגמא הצעות נישואין, מסיבת יום הולדת שהוא לא ידע עלייה או ציור מושקע על ידי קריקטוריסט או כל אומן אחר.
במצב זה הכליות משחררות אנדרנלין לזרימת הדם בגוף ומאיצים את פעילות הלב, מחזקים את מחזור הדם בגוף , מחזור הדם מגדיל את אספקתו לגוף תוך שהוא שולח את הדם מהקיבה ומאיברים בלתי חיוניים במצב חירום.
הרגשות של האדם מאופיינות על ידי תחושות שנוצרו בעקבות לחצים ומצבים קריטיים המאחדים את המוח והגוף להתמודדות מול פני הסכנה. מאבק זה מאופיין בשינויים פיזיולוגיים בגוף שנועדו לסייע לאדם להתגבר על הבעיה הקיומית. כאשר התחושות הינן קלות השינויים בגוף הינם זעירים .
בעת קיומן שלתחושות פחד וחרדה נוצרים שינויים פיזיולוגיים בגוף המאיצים את פעימות הלב את לחץ הדם וקצב הנשימה וזאת על מנת להתמודד עם הסיבה שגרמה לחרדה .
המאבק הקיומי של החשוד נובע מהחשש של חשיפה ,היא אשר מפעילה את מערכת ההישרדות הפיזיולוגית אשר משבשות את המחשבה הבהירה של הנבדק ומניעה אותו להימלט מיידית ממצב נפשי מביך .
בעת בדיקת פוליגרף יש ללמוד את הרקע ממנו בה הנבדק כגון : אמונה ודת , יושר אישי ומעמד חברתי . אלה עשויים ליצור אצלו קונפליקט פנימי , להניאו לאמור את האמת , למרות התוצאות הכרוכות בכך.
הידע והאבחנה ברגשות ותחושות של פחד וחרדה אצל נבדק הפוליגרף והתגובות הפיזיולוגיות והפסיכולוגיות הנובעות מכך יאפשרו לבודק הפוליגרף לפעול במקצועיות, בהבנה ובחוכמה דרכו לחקר האמת על ידי בדיקת פוליגרף.